Sesungguhnya Ahli Farmasi Indonesia ada sejak Proklamasi Kemerdekaan Negara Kesatuan Republik Indonesia pada tanggal 17 Agustus 1945. Mereka telah berjuang bahu-membahu dengan semua golongan masyarakat, untuk melenyapkan penjajahan dari muka bumi Indonesia, serta turut aktif mempertahankan Negara Kesatuan Republik Indonesia dan kemudian ikut serta dalam pembangunan masyarakat dan negara.

Oleh karena itu, Ahli Farmasi Indonesia merupakan salah satu potensi pembangunan yang tidak pernah absen dalam perjuangan pembangunan negara. Sebagai salah satu potensi pembangunan, Ahli Farmasi Indonesia selain menjalankan tugas keseharian, tetap ikut serta dalam mempertinggi taraf kesejahteraan umum, khususnya di bidang Kesehatan Masyarakat dan Farmasi.

Pada tanggal 13 Februari 1946, di Yogyakarta, dibentuklah suatu organisasi yang dinamakan “Persatuan Ahli Farmasi Indonesia” sebagai wadah untuk menghimpun semua tenaga yang bakti karyanya di bidang Farmasi. Persatuan Ahli Farmasi Indonesia selanjutnya disingkat “PAFI.”

PAFI dan Pengurus Pusat PAFI berkedudukan di wilayah Negara Kesatuan Republik Indonesia yang berazaskan Pancasila. Organisasi PAFI adalah organisasi profesi yang bersifat kekaryaan dan pengabdian.